在食品加工領域，從原料的采集、加工、儲存、運輸等各個環節，都有其嚴格的衛生標準，否則產品質量則無法得到保證。在食品加工中，應用臭氧消毒技術，使產品質量提高到一個新的水平。水產食品、速凍食品、冷凍食品、肉蛋奶製品等加工車間與包裝間，都有比較高的衛生要求，特別是生鮮食品由於終沒有加熱消毒工序，生產車間的微生物汙染是影響產品質量的極重要因素。臭氧用於食品加工車間消毒效果很好，一般5-10ppm即可達到99%以上的殺菌率，並可去除車間異味，提高產品質量。臭氧殺菌效果與環境溫度成反比，與濕度成正比，對食品加工行業80%-90%高濕度環境特別適合。臭氧設備運行環境要求溫度、濕度較低，且大型生產車間均分為多類區域，因此采用外部輸入臭氧導入方式，即臭氧設備安裝於機房，通過管道將臭氧氣體輸入車間各區域實現集中式消毒。